Основным отличием септика от автономной канализации является принцип работы и степень очистки. Уровень очистки септика — 50-60%, автономная канализация очищает стоки до 95-98%. Вода из автономной канализации считается технической и может вторично использоваться для полива. Высокая степень очистки достигается за счет принципа аэробной очистки, а в обычном септике процесс происходит за счет гниения.